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MOEでは分子力学・分子動力学計算、配座解析、分子アラインメント、静電ポテンシャル計算等の各種シミュレーションを行うことができます。
計算結果はデータベースビューアのグラフ機能、アニメーション機能等で解析します。 GizMOEという独自の機能を用いると、エネルギー極小化計算を行いながら、分子の構築や、ドッキング等のインタラクティブな操作が可能です。

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記述子計算 VSA(van der Waals surface area)記述子 統計解析ツール QSARモデル構築 線形モデル 確立モデル 判別モデル ライブラリ設計 分子フィルタ 分子構造の3次元化 CombiGen CombiDesign ライブラリ解析 フィンガープリント計算 クラスター解析 Similarity/Diversity HoleFiller

VSA記述子による解析例 拡大イメージ

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プロテインデータベース Protein Databaseホモロジー 検索用ファミリーデータベース ホモロジーモデリング用テンプレートデータベース ホモロジー検索 配列アラインメント 立体構造予測 タンパク質の構造解析 ロータマエクスプローラー

タンパク質モデリング 拡大イメージ

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MOEは、タンパク質の表面解析やリガンド結合部位探索を行い、ドッキングシミュレーションを行うことができます。また、候補化合物やリガンド結合部位探索の情報をもとに、ファーマコフォアモデルを作成し、3次元データベース検索を行うことが容易にできます。3次元データベース構築のために、大量な化合物の処理に適した高速配座解析機能も提供しています。